MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 plasmid pQpDG

Total Repeats: 812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009726	GGGT	2	8	166	173	0 %	25 %	75 %	0 %	154688252
2	NC_009726	GGT	2	6	246	251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688252
3	NC_009726	AGA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
4	NC_009726	GAAC	2	8	412	419	50 %	0 %	25 %	25 %	154688252
5	NC_009726	CA	3	6	422	427	50 %	0 %	0 %	50 %	154688252
6	NC_009726	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	154688252
7	NC_009726	GAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688252
8	NC_009726	GTC	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363623
9	NC_009726	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
10	NC_009726	CCG	2	6	733	738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209363623
11	NC_009726	GGTA	2	8	808	815	25 %	25 %	50 %	0 %	209363623
12	NC_009726	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
13	NC_009726	GCTG	2	8	889	896	0 %	25 %	50 %	25 %	209363623
14	NC_009726	CAT	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363623
15	NC_009726	CAATGG	2	12	937	948	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209363623
16	NC_009726	TGA	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363623
17	NC_009726	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
18	NC_009726	AGA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363623
19	NC_009726	A	7	7	1051	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	209363623
20	NC_009726	TTCA	2	8	1726	1733	25 %	50 %	0 %	25 %	154688289
21	NC_009726	CTA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688289
22	NC_009726	AC	3	6	1756	1761	50 %	0 %	0 %	50 %	154688289
23	NC_009726	TGG	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688289
24	NC_009726	TGC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
25	NC_009726	ATCA	2	8	1822	1829	50 %	25 %	0 %	25 %	154688289
26	NC_009726	TC	3	6	1844	1849	0 %	50 %	0 %	50 %	154688289
27	NC_009726	CAA	2	6	1867	1872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688289
28	NC_009726	TTA	2	6	1933	1938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688289
29	NC_009726	AGCA	2	8	2056	2063	50 %	0 %	25 %	25 %	154688289
30	NC_009726	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	154688289
31	NC_009726	TGT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688289
32	NC_009726	T	6	6	2163	2168	0 %	100 %	0 %	0 %	154688289
33	NC_009726	TCG	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
34	NC_009726	GGGGAA	2	12	2274	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688289
35	NC_009726	TG	3	6	2289	2294	0 %	50 %	50 %	0 %	154688289
36	NC_009726	TCG	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688289
37	NC_009726	GCCGCG	2	12	2460	2471	0 %	0 %	50 %	50 %	154688289
38	NC_009726	GGC	2	6	2620	2625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154688289
39	NC_009726	AAAT	2	8	2908	2915	75 %	25 %	0 %	0 %	154688312
40	NC_009726	A	7	7	2943	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	154688312
41	NC_009726	ATG	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
42	NC_009726	TGA	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688312
43	NC_009726	GAAA	2	8	3459	3466	75 %	0 %	25 %	0 %	154688312
44	NC_009726	A	6	6	3468	3473	100 %	0 %	0 %	0 %	154688312
45	NC_009726	ATT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688312
46	NC_009726	AC	3	6	3532	3537	50 %	0 %	0 %	50 %	154688312
47	NC_009726	T	6	6	3544	3549	0 %	100 %	0 %	0 %	154688312
48	NC_009726	GTG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688312
49	NC_009726	ATG	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
50	NC_009726	A	6	6	3686	3691	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
51	NC_009726	AAT	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
52	NC_009726	ATG	2	6	3731	3736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
53	NC_009726	TTGC	2	8	3771	3778	0 %	50 %	25 %	25 %	154688308
54	NC_009726	A	7	7	3842	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
55	NC_009726	TGA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
56	NC_009726	A	6	6	3924	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	154688308
57	NC_009726	CTT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
58	NC_009726	ATGG	2	8	3990	3997	25 %	25 %	50 %	0 %	154688308
59	NC_009726	TCTT	2	8	4043	4050	0 %	75 %	0 %	25 %	154688308
60	NC_009726	TTG	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
61	NC_009726	GAT	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
62	NC_009726	CAT	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688308
63	NC_009726	TAA	2	6	4337	4342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688308
64	NC_009726	TTGA	2	8	4378	4385	25 %	50 %	25 %	0 %	154688308
65	NC_009726	TGA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688308
66	NC_009726	CTT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688308
67	NC_009726	GGA	2	6	4471	4476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154688308
68	NC_009726	GTT	3	9	4488	4496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688308
69	NC_009726	TTGC	2	8	4909	4916	0 %	50 %	25 %	25 %	154688260
70	NC_009726	CA	4	8	4936	4943	50 %	0 %	0 %	50 %	154688260
71	NC_009726	ATAC	2	8	4968	4975	50 %	25 %	0 %	25 %	154688260
72	NC_009726	TAT	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688260
73	NC_009726	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	154688260
74	NC_009726	TCT	2	6	5073	5078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688260
75	NC_009726	ATG	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688260
76	NC_009726	T	6	6	5549	5554	0 %	100 %	0 %	0 %	209363624
77	NC_009726	GCAAT	2	10	5568	5577	40 %	20 %	20 %	20 %	209363624
78	NC_009726	CAA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
79	NC_009726	AGG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209363624
80	NC_009726	GAA	2	6	5750	5755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
81	NC_009726	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
82	NC_009726	A	6	6	5972	5977	100 %	0 %	0 %	0 %	209363624
83	NC_009726	CAT	2	6	5998	6003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
84	NC_009726	ATT	3	9	6009	6017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
85	NC_009726	AACGC	2	10	6029	6038	40 %	0 %	20 %	40 %	209363624
86	NC_009726	CTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363624
87	NC_009726	TGA	2	6	6178	6183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
88	NC_009726	CG	3	6	6222	6227	0 %	0 %	50 %	50 %	209363624
89	NC_009726	GCA	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
90	NC_009726	AGA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
91	NC_009726	AGT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363624
92	NC_009726	CGCA	2	8	6478	6485	25 %	0 %	25 %	50 %	209363624
93	NC_009726	A	6	6	6569	6574	100 %	0 %	0 %	0 %	209363624
94	NC_009726	GC	3	6	6702	6707	0 %	0 %	50 %	50 %	209363624
95	NC_009726	AT	3	6	6740	6745	50 %	50 %	0 %	0 %	209363624
96	NC_009726	CA	3	6	6761	6766	50 %	0 %	0 %	50 %	209363624
97	NC_009726	CAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
98	NC_009726	ATT	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
99	NC_009726	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
100	NC_009726	AAC	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
101	NC_009726	GAA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
102	NC_009726	ATT	2	6	7066	7071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209363624
103	NC_009726	CAAT	2	8	7114	7121	50 %	25 %	0 %	25 %	209363624
104	NC_009726	GTT	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209363624
105	NC_009726	CAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363624
106	NC_009726	CGA	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209363624
107	NC_009726	CTA	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363624
108	NC_009726	GAA	2	6	7295	7300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209363624
109	NC_009726	GATG	2	8	7358	7365	25 %	25 %	50 %	0 %	209363624
110	NC_009726	AAT	2	6	7462	7467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688294
111	NC_009726	T	6	6	7495	7500	0 %	100 %	0 %	0 %	154688294
112	NC_009726	TTTGG	2	10	7609	7618	0 %	60 %	40 %	0 %	154688294
113	NC_009726	G	6	6	7617	7622	0 %	0 %	100 %	0 %	154688294
114	NC_009726	AAAT	2	8	7623	7630	75 %	25 %	0 %	0 %	154688294
115	NC_009726	TGG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688294
116	NC_009726	GAT	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688294
117	NC_009726	CAAA	2	8	7695	7702	75 %	0 %	0 %	25 %	154688294
118	NC_009726	A	6	6	7843	7848	100 %	0 %	0 %	0 %	154688257
119	NC_009726	TTA	2	6	7964	7969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688257
120	NC_009726	AT	3	6	7976	7981	50 %	50 %	0 %	0 %	154688257
121	NC_009726	A	6	6	7985	7990	100 %	0 %	0 %	0 %	154688257
122	NC_009726	GAT	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154688257
123	NC_009726	GCA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688257
124	NC_009726	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688257
125	NC_009726	GTT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688257
126	NC_009726	T	7	7	8515	8521	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
127	NC_009726	TTC	2	6	8525	8530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
128	NC_009726	AAC	2	6	8558	8563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154688273
129	NC_009726	GAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154688273
130	NC_009726	T	7	7	8706	8712	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
131	NC_009726	TAC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
132	NC_009726	TCG	2	6	8799	8804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154688273
133	NC_009726	CTC	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154688273
134	NC_009726	T	7	7	8881	8887	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
135	NC_009726	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
136	NC_009726	A	7	7	9021	9027	100 %	0 %	0 %	0 %	154688273
137	NC_009726	TCT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
138	NC_009726	TTG	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154688273
139	NC_009726	CTT	2	6	9074	9079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
140	NC_009726	T	7	7	9078	9084	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
141	NC_009726	CCAT	2	8	9112	9119	25 %	25 %	0 %	50 %	154688273
142	NC_009726	CGC	2	6	9146	9151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688273
143	NC_009726	ATC	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
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145	NC_009726	TAAAA	2	10	9215	9224	80 %	20 %	0 %	0 %	154688273
146	NC_009726	TCGC	2	8	9233	9240	0 %	25 %	25 %	50 %	154688273
147	NC_009726	AGC	2	6	9257	9262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688273
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151	NC_009726	TTC	3	9	9386	9394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
152	NC_009726	TCTT	2	8	9428	9435	0 %	75 %	0 %	25 %	154688273
153	NC_009726	CGA	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154688273
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155	NC_009726	AAGA	2	8	9522	9529	75 %	0 %	25 %	0 %	154688273
156	NC_009726	TCT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
157	NC_009726	GCTTG	2	10	9574	9583	0 %	40 %	40 %	20 %	154688273
158	NC_009726	T	6	6	9658	9663	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
159	NC_009726	TCT	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
160	NC_009726	A	6	6	9683	9688	100 %	0 %	0 %	0 %	154688273
161	NC_009726	TTC	3	9	9689	9697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154688273
162	NC_009726	GGT	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154688273
163	NC_009726	GCC	2	6	9706	9711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154688273
164	NC_009726	GCTT	2	8	9737	9744	0 %	50 %	25 %	25 %	154688273
165	NC_009726	CAT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154688273
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168	NC_009726	G	6	6	9924	9929	0 %	0 %	100 %	0 %	154688273
169	NC_009726	T	6	6	9932	9937	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
170	NC_009726	ATA	2	6	10037	10042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154688273
171	NC_009726	T	6	6	10061	10066	0 %	100 %	0 %	0 %	154688273
172	NC_009726	ACC	2	6	12267	12272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154688265
173	NC_009726	TAAA	2	8	12321	12328	75 %	25 %	0 %	0 %	154688265
174	NC_009726	CATCT	2	10	12342	12351	20 %	40 %	0 %	40 %	154688265
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180	NC_009726	ATT	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154688265
181	NC_009726	TATT	2	8	12770	12777	25 %	75 %	0 %	0 %	154688265
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266	NC_009726	TGA	2	6	17153	17158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363628
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392	NC_009726	TCGA	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	209363632
393	NC_009726	TCC	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209363632
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